手册中主要介绍了对SARS-CoV-2基因组序列的处理和分析，序列可以是从公共数据库下载或者是本地生成的数据。每个单独基因组序列被分成一系列子序列（从序列中提取多个部分序列），每一个序列会根据参考基因组进行SNP的分析。所有的SNP以开放的（动态）字符集存储，这些字符集能够在现有的最高分辨率下进行简单的对比和菌株分型。

SarsCoV2插件是免费提供的。如果要安装该插件，Bionumerics软件的最低配置为“特征数据模块”、“序列数据模块”、“树状网络分析模块”和“基因组分析工具模块”。