微生物精准鉴定与溯源培训班(第二期) 在武汉顺利召开
为进一步提升微生物鉴定与溯源技术在检验业务中的应用,提高微生物实验室专业人员的理论和操作技能,中国食品药品检定院于2021年5月18日一19日在湖北省武汉市举办了微生物精准鉴定与溯源技术培训班(第二期)。本次培训包含生化、微生物质谱、16S测序、全基因组测序等基础理论知识及微生物溯源系统实操两部分。参与培训的包括食品药品检验检测机构相关人员、医院、疾控中心、食品药品生产研发企业等从事相关工作的一百五十多人。
我司作为中检院国家食品安全关键技术研发“十三五”课题“食品监管微生物追踪技术与网络平台建设项目的课题参与单位,承担了培训第2天全基因组测序数据存储、分析与溯源实操部分的全天授课。
在会议上,我司生物信息部门负责人崔箐坡对测序技术的发展及相关背景、微生物分子分型技术、微生物精准鉴定及溯源分析及相关生物信息学背景知识等进行了介绍,同时带领学员在我司自主开发的GenesClouds微生物全基因数据存储和分析平台上进行了实操。该平台运用了最优化的算法和高性能的弹性伸缩计算,实现了全基因数据分析的标准化、图形化和流程化,解决了高通量全基因组数据的安全储存、快速计算、精准比对和可视化展示等难题,形成了全基因组数据快速综合分析及组网溯源预警能力,能够为我国传染病防治、食品安全事故处置和精准溯源预警等提供坚实技术支撑。
在实操环节中,所有学员在授课老师的引导下,分别同步进行了测序数据上传、质控、拼接、特征基因分析(耐药和毒力)、基因组注释、MLST、cgMLST、wgSNP、菌种鉴定和聚类分析等微生物数据分析核心功能的操作和实践,对生物信息中全基因数据分析原理和流程,有了更深入的了解和更实际的切身体验。
本培训会的圆满结束,必将促进基于WGS数据的微生物精准鉴定与溯源分析平台广泛应用于我国各层级微生物检测实验室,引领微生物测序数据分析技术向高效、快速、准确的方向发展,将有力支撑微生物安全监测工作,尤其在重大微生物安全事件发生时,可快速识别并召回引起危害的相关产品,从而精准终止安全事件的进程,最大限度地保护消费者生命健康安全。