微生物全基因数据管理与分析系统组快速分析系统
产品介绍
系统能够处理各类微生物的全基因组/宏基因组数据。系统提供高性能的数据存储和索引机制，确保您可以快速上传、访问和管理海量的基因组数据。系统的数据组织结构和搜索功能让您能够方便的找到所需的数据和结果。
系统特点
统一存储
提供适用于微生物实验室的易用的全基因/宏基因测序数据管理工具，解决数据存储问题，可实现多国家、省、地市、区县等多级组织架构的数据管理，并构建专属的微生物全基因组数据库。
高效分析
GenesClouds内置丰富的数据分析工具，包括基因组组装全基因组SNP分析、基因功能注释、耐药、毒力相关的特征基因分析等。您可以利用这些工具对数据进行深入挖掘。
精准溯源
GenesClouds为不同行业的从业人员提供精准的微生物预警溯源平台，按照不同行业提供定制化的预警指标和闯值，满足不同监测的需求，为保障公共卫生安全贡献力量。
主动预警
触发GenesClouds的预警条件时，预警系统将自动启动，并生成相应的预警信息。支持预警信息到手机端的推送，使得问题能够被及时发现并得到妥善处理，从而避免潜在的损失和风险。
系统优势
生信分析能力
软件系统云端支持300台以上并行计算。已为客户实现10万株菌的分析。在虚拟环境中部署时能够根据运算量自动进行 弹性伸缩。
硬件设备配置192核，512G内存，单株拼接分析20分钟完成。可支持3-5株并行计算。50T超大存储容量，实现海量基因数据长期、完整、安全的 保存。采用双固态硬盘进行高速缓存，提升数据的存储和处理能力。自主研发的核心关键技术，具备较强的稳定性和可靠性。
易用性
内置国际常用标准库，无需客户二次投入费用进行菌株库下载，满足客户学习、研究和生产需要内置常用分析模块，提供全方位微生物分析流程可以高效完成从下机数据到报告的一键式全流程分析。
根据客户的业务需求定制系统展示的菌株属性，并可以和样本库进行关联。
多用户管理
多个用户可以共享服务器资源，例如数据库、文件、应用程序等。
团队成员可以通过多用户登录方式快速地进行协同办公。
管理员可以方便地对多个用户进行管理和授权，提高管理效率。
多用户登录可以设置不同的权限，保障数据的安全性.
扩展及组网能力
微生物全基因数据管理与分析系统拥有强大的水平扩展能力及组网能力，现已实现微生物分子溯源组网络的建设，由国家服务器与省级、地市级、区县级安装的服务器对接组成，实现组网内菌株信息、分子分型图谱和药敏实验等数据的实时上报、在线分析和数据共享。
TraNet融合接入
系统实现与国家食源性疾病分子溯源网络(TraNet)对接，该网络由国家食品安全风险评估中心(CFSA)部署的BioNumerics 服务器端与省食源性分子溯源网络、地市级疾病预防控制中心安装的本地设备对接组成，实现全国各地菌株信息、分子分型图谱和药敏实验等数据能实时上报、在线分析、数据共享和全基因组测序数据分析等功能，对发现和控制食源性疾病暴发，追踪溯源病因食品具有重要意义。
数据分析功能
序列对比与组装
基因注释与功能预测
全基因组SNP分析
wgMLST分析
耐药基因检测/毒力因子分析
基因组同源性比较
菌种鉴定
交互式数据可视化
使用场景
数据管理
为微生物实验室提供易用的全基因测序，解决单位内数据管理，多单位数据联网管理，构建微生物全基因组数据库。
菌种鉴定
为科研人员提供高效的微生物全基因数据，满足菌种鉴定、拼接wgMLST、wgSNP、可视化的需要。通过全基因组数据分析平台其强大的数据库系统，实验室可随时将可疑菌的检测结果与数据库中致病菌基因图谱进行比对，及时快速的识别致病菌。
预警溯源
采用统计聚类分析技术、基线判断与趋势评估方法，实现食源性疾病疑似暴发事件识别，同时具备暴发事件管理、流调状态登记管理以及分析图表数据离线输出等暴发识别综合管理功能。为不同行业构建精准的致病菌风险监测，解决疾控传染病防治、市场监管食品安全、海关口岸疫情监测等需求。
